کتاب تربیت ولایی | یکی از ویژگی‌های مشترک در آثار استاد میرباقری این است که برای مفاهیمی که غالباً به گوشمان خورده و در ذهنمان تعاریفی برایشان داریم، مبتنی بر معارف وحیانی چنان تبیینی انجام می‌دهند که ما را با افق بسیار عمیق‌تر و دقیق‌تری از معنای حقیقی آن مفاهیم از منظر اسلام ناب آشنا می‌کنند؛ این اثر هم که گلچینی از آثار و سخنان ایشان مرتبط با بحث سلوکی الی الله هست، از این ویژگی‌ مشترک آثار ایشان، نه تنها بی‌بهره نیست، بلکه بهره‌ی فراوان دارد!

این کتاب در واقع چکیده اندیشه اخلاقی استاد میرباقری و بازتاب آن در صحبت‌ها و سخنرانی‌های ایشان در دهه‌های اخیر است. کتاب پر است از نکات اخلاقی و سلوکی که با زبانی ساده و روان مناسب عموم افراد علاقه‌مند به این مباحث است.

مجموعه کتب تاملات قرآنی، شامل سلسله مباحث تفسیر ترتیبی استاد سیدمحمدمهدی میرباقری است که می تواند گامی رو به پیش در رویکرد های تفسیری مبتنی بر معارف اهل بیت شمرده شود.